Thoirette-Coisia est, depuis le 1er janvier 2017, une commune nouvelle française située dans le département du Jura, dans la région culturelle et historique de Franche-Comté et la région administrative Bourgogne-Franche-Comté. Sa population est de 809 habitants au recensement de 2023. Elle est membre de la communauté de communes Terre d'Émeraude.